Approches moléculaires proposées pour caractériser les fonctions écologiques microbiennes du sol dans le cadre d’une réhabilitation écologique

Résumé

Dans le cadre des travaux que RECORD a conduit sur l’évaluation du succès des opérations de réhabilitation écologique de sites et sols dégradés, un outil de suivi opérationnel destiné aux gestionnaires et industriels a été proposé. Une des matrices établie dans cette étude identifie les fonctions et processus écologiques réalisés par les sols, les indicateurs de ces processus ainsi que les outils de mesure disponibles pour les évaluer. Parmi ces outils sont proposés la quantification de la biomasse moléculaire des sols, l’évaluation de la diversité microbienne par séquençage d’ADN microbien et la mesure de l’abondance de gènes impliqués dans des activités spécifiques. L’objectif de cette note est de présenter les approches moléculaires de mesure de la diversité génétique et fonctionnelle des communautés microbiennes qui sont actuellement à différents niveaux d’opérationnalité.